医院神经外科是医院重点专科，现拥有医护人员22人、医生7人、护士15人，其中主任医师2人、副主任医师1人、主治医师1人、主管护师3人、护师4人，实际开放床位46张，重症ICU床位9张。医院拥有的美国大宝石CT、3.0T静音磁共振、GE大型血管机等设备居省级领先水平，能够帮助临床医生快速、准确地判断病情及治疗。
科室目前承担着医院乃至整个商丘市的急性脑卒中救治工作，能够独立做急性脑卒中急诊介入手术。为方便病人诊治，科室为急性脑出血、脑梗死开通了绿色通道，到院后，可直接至导管室手术，这样可以更加快速地让病人得到有效治疗。
在急性脑血管病治疗中，中医院神经外科在我市率先开展了动脉瘤介入及脑血栓拉栓治疗，填补了商丘市医疗界的空白，得到了患者及社会的一致好评，取得了很好的社会效益。在颅脑损伤方面，医院内绿色通道紧密相接，入院即可进行手术，疾病稳定期及时引入康复治疗等，大大降低了急性重型脑卒中、脑外伤患者的死亡和致残率，在区域内达到先进水平。
目前，神经外科主要开展颅脑损伤、颅内血肿、脑挫裂伤、脑干损伤等疾病的诊治，特别是在重型颅脑损伤的救治方面积累了丰富的经验，使治疗效果明显提高。
对颅内肿瘤，如颅内各种部位的神经胶质瘤、脑膜瘤、垂体腺瘤、颅咽管瘤、听神经瘤以及枕骨大孔区肿瘤、脑室肿瘤等方面的治疗有着丰富的经验。
在血管病方面，开展对高血压脑出血、脑动脉瘤、脑血管畸形、烟雾病、脑梗死、颈内动脉狭窄等疾病的治疗。
对颅脑和脊柱的先天畸形疾病开展治疗业务，包括小脑扁桃体下疝、颅底凹陷、颅裂、脊柱裂、脑积水等。
在神经系统功能性疾病方面，包括三叉神经痛、面肌痉挛等，并能在内镜下开展经单鼻孔入路垂体肿瘤切除术，为患者减轻痛苦。
神经外科不仅在脑血管病领域造诣非凡，在脑内血肿的微创治疗方面亦有较深造诣。年在河南省率先开展了3D重建打印下脑内血肿微创精准治疗，并取得很好效果，不仅损伤小、恢复好，而且花费较少。近年来神经系统肿瘤手术也发展迅速，医院医院神经介入专家穆士卿教授，首都医科医院张家栋教授及郑大一附院专家、徐州医科大学二附院神经外科专家团队来院坐诊手术。
医院神经外科团队全体医护人员急病人之所急，想病人之所想，全心全意守护患者健康。